應(yīng)用場(chǎng)景:用于捕獲RNA編碼區(qū)的高通量測(cè)序分析,尤其適用于降解嚴(yán)重的FFPE樣本; 適配機(jī)型:MGISEQ-2000
MGIEasy RNA Exome應(yīng)用主要用于人源樣本的RNA編碼區(qū)定量分析,該應(yīng)用整合了RNA方向性文庫(kù)制備和外顯子捕獲技術(shù),將人源total RNA轉(zhuǎn)化成已知RNA鏈起源方向的雙鏈DNA分子,然后對(duì)其外顯子序列進(jìn)行特異性捕獲,最終制備成適合于MGI高通量測(cè)序儀測(cè)序的文庫(kù),為FFPE 樣本和其他低質(zhì)量人源樣品的mRNA表達(dá)定量測(cè)序分析提供了一種高效、完整的產(chǎn)品組合。
MGIEasy RNA Exome應(yīng)用專注于降解樣本的RNA編碼區(qū)的定量分析,從total RNA中捕獲RNA編碼區(qū),有助于最大限度地提高mRNA定量的精準(zhǔn)性,且相比于非RNA Exome測(cè)序,達(dá)到相同的RNA編碼區(qū)測(cè)序深度時(shí)所需的測(cè)序數(shù)據(jù)量更少。
MGIEasy RNA Exome應(yīng)用產(chǎn)品包含了MGIEasy RNA方向性文庫(kù)制備試劑套裝(1000006385)、MGIEasy 外顯子組捕獲V5探針試劑套裝(940-000187-00)和MGIEasy 外顯子組捕獲輔助試劑盒(1000007743),本建庫(kù)操作指南將為您詳細(xì)介紹MGIEasy RNA Exome文庫(kù)的制備技術(shù)。
貨號(hào):1000006385
核心建庫(kù) | MGIEasy RNA方向性文庫(kù)制備試劑盒 V2.0(16 RXN) | 1000005270 |
接頭 | MGIEasy DNA Adapters-16(管式)試劑盒 V1.0(16 RXN,16 barcodes) | 1000005284 |
純化磁珠 | MGIEasy DNA 純化磁珠試劑盒 | 1000005278 |
環(huán)化 | MGIEasy環(huán)化模塊 V2.0 | 1000005260 |
貨號(hào):940-000187-00
探針 | MGIEasy外顯子組捕獲 V5探針試劑盒(16RXN) | 1000007741 |
雜交洗脫 | MGIEasy 外顯子組捕獲雜交洗脫試劑盒(Box 1)(16RXN) | 940-000168-00 |
雜交洗脫 | MGIEasy 外顯子組捕獲雜交洗脫試劑盒(Box 2)(16RXN) | 940-000169-00 |
貨號(hào):1000007743
捕獲輔助 | MGIEasy 外顯子組捕獲輔助試劑盒 V1.0(16 RXN) | 1000007743 |
樣本低投入量 Total RNA起始量可低至10 ng,且在不同起始量下文庫(kù)均有出色、穩(wěn)定的數(shù)據(jù)表現(xiàn)。 | 對(duì)嚴(yán)重降解低質(zhì)量樣本也能適用 針對(duì)FFPE樣本和其他降解嚴(yán)重的低質(zhì)量樣本也能適用,可以獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)。 |
專注于RNA編碼區(qū)的定量分析 通過外顯子捕獲的方式獲得RNA編碼區(qū),Exon比例達(dá)60%以上,相同的RNA編碼區(qū)depth所需數(shù)據(jù)量更少。 | 優(yōu)異的重復(fù)性 低質(zhì)量樣本建庫(kù)重復(fù)性可達(dá)0.99以上。 |
應(yīng)用名稱 | MGIEasy RNA Exome |
應(yīng)用指導(dǎo) | MGIEasy RNA Exome 建庫(kù)操作指南 |
所需試劑盒信息 | MGIEasy RNA方向性文庫(kù)制備試劑套裝 MGIEasy 外顯子組捕獲V5探針試劑套裝 MGIEasy 外顯子組捕獲輔助試劑盒 |
規(guī)格 | 16 RXN |
所需樣本量 | 10 ng-100 ng total RNA |
樣本類型 | 冰凍組織、FFPE樣本 |
適用物種 | 人 |
建庫(kù)時(shí)間 | 32 h |
應(yīng)用方向 | RNA-Seq |
適用的測(cè)序平臺(tái) | MGISEQ-2000 |
推薦的測(cè)序讀長(zhǎng) | PE100 |
推薦的測(cè)序深度/Raw reads數(shù) | PE100 / 25M reads |
MGIEasy RNA Exome建庫(kù)操作指南由深圳華大智造科技有限公司 為您提供,如您想了解更多關(guān)于MGIEasy RNA Exome建庫(kù)操作指南報(bào)價(jià)、CAS號(hào)、貨號(hào)、參數(shù)等信息 ,歡迎來電或留言咨詢。
注:該產(chǎn)品未在中華人民共和國(guó)食品藥品監(jiān)督管理部門申請(qǐng)醫(yī)療器械注冊(cè)和備案,不可用于臨床診斷或治療等相關(guān)用途。