吉?jiǎng)P助力!IF10| 山東省立醫(yī)院研究團(tuán)隊(duì)揭示miRNA在阿爾茲海默病中的功能和作用機(jī)制
已有研究表明,阿爾茲海默病(AD)患者的腦組織或血清中存在許多下調(diào)的miRNA,它們可能參與了老年斑和神經(jīng)纖維纏結(jié)的形成。miRNA-22-3p即為其中之一,但其分子機(jī)制尚未被充分研究。
山東省立醫(yī)院的研究團(tuán)隊(duì)對(duì)miRNA-22-3p在AD中的功能和作用機(jī)制進(jìn)行了探索。研究成果以“MicroRNA-22-3p ameliorates Alzheimer’s disease by targeting SOX9 through the NF-κB signaling pathway in the hippocampus”為題,發(fā)表在Journal of Neuroinflammation(IF:9.587 )上。
研究思路
研究結(jié)果
1. miRNA-22-3p在AD中的表達(dá)情況及疾病相關(guān)性
研究者對(duì)GEO數(shù)據(jù)庫中AD的miRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行了檢索分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)miRNA-22-3p在AD患者的腦組織和血液中均下調(diào)。研究者進(jìn)一步利用DIANA-mitED數(shù)據(jù)庫分析了miRNA-22-3p在其他組織或體液中的表達(dá)情況。此外,miRNA與疾病的相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn)miRNA-22-3p與副神經(jīng)節(jié)瘤、混合膠質(zhì)瘤、星形細(xì)胞瘤、帕金森、自閉癥、海馬硬化和亨廷頓病等多種疾病相關(guān)。
2.In Vitro實(shí)驗(yàn):miRNA-22-3p可降低Aβ(β淀粉樣蛋白)誘導(dǎo)的神經(jīng)元細(xì)胞凋亡
鑒于miRNA-22-3p在AD中下調(diào),研究者先用Aβ(β淀粉樣蛋白)處理小鼠海馬神經(jīng)元細(xì)胞系HT22構(gòu)建AD細(xì)胞模型。Aβ處理后,HT22細(xì)胞發(fā)生顯著凋亡。緊接著,研究者在細(xì)胞中加入miRNA-22-3p的類似物(agomir)實(shí)現(xiàn)過表達(dá)并檢測(cè)對(duì)細(xì)胞凋亡的影響。結(jié)果表明,過表達(dá)miRNA-22-3p抑制AD細(xì)胞凋亡(凋亡蛋白Bax下調(diào),抗凋亡蛋白Bcl-2上調(diào))。
3. In Vivo實(shí)驗(yàn):miRNA-22-3p可改善AD小鼠的認(rèn)知功能和降低Aβ沉積
隨后,研究者在AD小鼠模型中檢測(cè)了miRNA-22-3p的作用。研究者分別在AD小鼠的大腦海馬區(qū)注射miRNA-22-3p類似物(agomir,過表達(dá))和拮抗劑(antagomir,抑制),觀察小鼠認(rèn)知功能變化及神經(jīng)元細(xì)胞中Aβ的沉積情況。結(jié)果表明,過表達(dá)miRNA-22-3p可顯著改善AD小鼠的認(rèn)知功能和降低Aβ沉積,而抑制miRNA-22-3p則加劇癥狀。
4. 機(jī)制研究:miRNA-22-3p調(diào)控蛋白變化
miRNA的經(jīng)典作用機(jī)制是通過與mRNA結(jié)合,降解mRNA或者抑制mRNA翻譯成蛋白質(zhì)。因此,miRNA可調(diào)控靶基因的表達(dá)?;诖耍芯空呃肨MT蛋白質(zhì)組學(xué)(吉?jiǎng)P助力)分別對(duì)PBS處理(對(duì)照組,n=3)、miRNA agomir(過表達(dá)組,n=3)和miRNA antagomir(抑制組,n=3)的小鼠海馬體組織進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè),以尋找miRNA-22-3p的靶基因。蛋白質(zhì)組學(xué)結(jié)果發(fā)現(xiàn)了一些蛋白的表達(dá)變化,研究者進(jìn)一步通過GO和KEGG富集分析揭示了這些差異蛋白參與的功能和信號(hào)通路。
5. 機(jī)制研究:miRNA-22-3p靶向SOX9,并參與NF-κB信號(hào)通路
通過蛋白質(zhì)組學(xué)分析,研究者鎖定了一個(gè)差異蛋白SOX9。序列分析表明,miRNA-22-3p與SOX9有很強(qiáng)的序列互補(bǔ)結(jié)合,SOX9是miRNA-22-3p潛在的靶基因。隨后,研究者通過熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)明確了miRNA-22-3p和SOX9之間的靶向關(guān)系。有研究表明SOX9與NF-κB信號(hào)通路有關(guān),因此,研究者挑選了NF-κB復(fù)合體中的蛋白進(jìn)行了驗(yàn)證。結(jié)果表明,當(dāng)miRNA-22-3p顯著上升時(shí),SOX9和NF-κB復(fù)合體蛋白的表達(dá)均下調(diào);miRNA-22-3p下調(diào)時(shí),SOX9和NF-κB復(fù)合體蛋白的表達(dá)上調(diào)。因此,研究者提出miRNA-22-3p的作用機(jī)制:miRNA-22-3p上調(diào)導(dǎo)致NF-κB通路中的SOX9的下調(diào)及凋亡蛋白Bax 的下調(diào)及抗凋亡蛋白Bcl-2的上調(diào),最終減少Aβ沉積和神經(jīng)元凋亡,減輕阿爾茲海默病。
研究總結(jié)
本研究探索了miRNA-22-3p在阿爾茲海默病(AD)中的功能和作用機(jī)制。功能上,過表達(dá)可顯著改善小鼠海馬神經(jīng)元細(xì)胞系HT22細(xì)胞的凋亡、改善阿爾茲海默病模型小鼠的認(rèn)知功能、減輕β淀粉樣蛋白(Aβ)沉積。機(jī)制上,研究者采用TMT蛋白質(zhì)組學(xué)(吉?jiǎng)P助力)尋找miR-22-3p的靶基因,并通過雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)驗(yàn)證了Sox9是其靶基因 。綜合以上結(jié)果表明,miR-22-3p通過靶向NF-κB通路中的Sox9,減少神經(jīng)元細(xì)胞凋亡和Aβ沉積,最終改善AD小鼠的認(rèn)知功能。
吉?jiǎng)P基因憑借多年在靶標(biāo)篩選及驗(yàn)證服務(wù)領(lǐng)域的技術(shù)積累,建立的標(biāo)準(zhǔn)化 、工程化 、系統(tǒng)化的GRP平臺(tái),為中國(guó)研究型醫(yī)生提供科研服務(wù),加快科研成果轉(zhuǎn)化。其中,多組學(xué)平臺(tái)包含蛋白質(zhì)組學(xué)平臺(tái)和高通量測(cè)序平臺(tái):
·蛋白質(zhì)組學(xué)平臺(tái)擁有多臺(tái)timsTOF Pro、Exploris 480高精度質(zhì)譜儀,專業(yè)領(lǐng)先的Spectronaut Plusar、Mascot等分析軟件,提供專業(yè)的4D、DIA、TMT、PRM、磷酸化修飾組、olink蛋白質(zhì)組等檢測(cè)服務(wù),強(qiáng)大的機(jī)器學(xué)習(xí)算法、IPA分析、蛋白基因組分析服務(wù),系統(tǒng)的生物標(biāo)志物、分子分型、藥物靶點(diǎn)、基因功能研究等解決方案,真正讓廣大研究型醫(yī)生的科研工作更省心、更省力、更高效;
·高通量測(cè)序平臺(tái)分為常規(guī)測(cè)序服務(wù)和單細(xì)胞測(cè)序服務(wù):?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序擁有10x和BD兩個(gè)平臺(tái),提供單細(xì)胞RNA-seq、單細(xì)胞核測(cè)序、單細(xì)胞混樣RNA-seq、單細(xì)胞TCR/BCR、單細(xì)胞(RNA+ATAC)、空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等服務(wù);常規(guī)測(cè)序服務(wù)提供meRIP-seq(m6A/m1A/m7G/m5C 等RNA甲基化修飾測(cè)序)、acRIP-seq(ac4C RNA乙?;揎棞y(cè)序)、ATAC-seq、Ribo-seq(翻譯組測(cè)序) 、mRNA/miRNA/LncRNA/circRNA-seq、全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(兩文庫/三文庫)、外泌體miRNA/LncRNA-seq、WGS/WES、WGBS、RRBS、BSAS等服務(wù)。
1.實(shí)驗(yàn)技術(shù)干貨
2.蛋白質(zhì)組學(xué)研究
3.腺病毒簡(jiǎn)介及應(yīng)用
4.臨床基礎(chǔ)研究思路解析
5.組織特異性腺相關(guān)病毒
6.單細(xì)胞測(cè)序
7.慢病毒實(shí)驗(yàn)操作指南
8.懸浮細(xì)胞專用病毒
9.靶點(diǎn)設(shè)計(jì)/數(shù)據(jù)庫教程
10.測(cè)序技術(shù)研究與應(yīng)用
11.非編碼RNA研究技術(shù)與應(yīng)用
12.腺相關(guān)病毒選擇/應(yīng)用
13.表觀遺傳研究
14.文章解析
15.國(guó)自然課題設(shè)計(jì)思路解析
16.生物信息分析及工具
17.外泌體研究
18.腫瘤免疫研究
19.高分文章
20.吉?jiǎng)P病毒神經(jīng)方向應(yīng)用案例